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雙脫氧氣鏈終止法標(biāo)定DNA序列操作
雙脫氧氣鏈終止法標(biāo)定DNA序列操作
DNA聚合酶催化的DNA鏈延伸是在3’-OH末端向上行的。因?yàn)?’,3’-雙脫氧氣三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脫氧氣而錯(cuò)過游離-OH,當(dāng)它參入到DNA鏈后,3’-OH末端消逝,使DNA鏈的延伸終止真空干燥箱。
本實(shí)驗(yàn)依據(jù)此原理,將待測(cè)DNA斷片**去單鏈?zhǔn)删wM13載體,并用合成的寡聚核苷酸引物與該載體上**去待測(cè)斷片的上游順著次序退火,隨即在T7DNA聚合酶催化下施行延伸反響。實(shí)際操作中同時(shí)施行,作別終止于A、G、C和T的4個(gè)反響整體體系。每個(gè)反響整體體系均含4種脫氧氣三磷酸核苷酸(dNTP)底物,那里面—種dATP為32P標(biāo)記物,以便能用放射自顯影法讀序。但在這4個(gè)反響整體體系中,作別加一種低液體濃度的ddNTP(ddATP、ddGTP、ddCTP或ddTTP),這么ddNTP可隨機(jī)參入正在延伸的DNA鏈上,使鏈延伸終止。例如在“A”管中加ddATP,反響終了時(shí),管內(nèi)全部新合成的DNA鏈都是以A結(jié)末的不一樣長度的斷片,并且這些個(gè)斷片都帶放射性。將反響物加在高辯白凝膠上電泳,DNA斷片則因其長度不一樣(分子量體積不一樣)被離合電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱,短的走在前端,長的泳動(dòng)在后面。其它3管則作別為以G,C或T結(jié)末的不一樣長度DNA斷片。
因?yàn)椋孩倏v然是參差相差一個(gè)核苷酸的DNA斷片,亦可依據(jù)其電泳距離的差別而加以區(qū)別;②A、G、C和T4種反響整體體系的產(chǎn)物在電泳凝膠中相鄰排列。因而在閱覽凝膠電泳的放射自顯影圖像時(shí),由下至上按前后順著次序即可將DNA的核苷酸順著次序讀出。